Gestiftet von Prof. Dr. Kühne, einem der renommiertesten Forscher im Themengebiet »Flucht, Asyl und Migration«, ist das Peter-Kühne-Archiv eine der bundesweit umfassendsten Sammlungen von Materialien zum Thema Flucht, Asyl und Migration. Das Archiv befindet sich in der Hochschul- und Landesbibliothek.

Das Archiv der Forschungsgesellschaft Flucht und Migration (in Gebäude 22, Fachbereich Sozial- und Kulturwissenschaften) ist ebenfalls eines der umfassendsten Archive zum Thema Flucht und Migration. Entstanden als Arbeitsarchiv in Berlin, dienten die vorhandenen Dokumente (veröffentlichte und nicht-veröffentlichte Materialien) der Forschungsgesellschaft Flucht und Migration als Grundlage für eigene Veröffentlichungen.

Aufgabe der wissenschaftlichen Sammlung UNESCO-Biosphärenreservat Rhön, inzwischen als dauerhafte Einrichtung in die Hochschul- und Landesbibliothek integriert, ist die Erschließung dezentral vorhandener Literatur- und Archivbestände, bisher nicht erfasster einschlägiger Materialien und Dokumente sowie der Aufbau einer Spezialsammlung zum Themenkomplex nachhaltiger Regionalentwicklung im Biosphärenreservat Rhön.